土木工程学院是东北林业大学规模最大的工科学院之一，前身是东北林学院1958年成立的林区道路工程专业；1964年成立林区道路工程系，1996年8月，经林业部批准，更名为土木工程学院。学院现有交通运输工程博士后流动站；林区交通工程和道路与铁道工程2个二级学科博士点；土木工程、管理科学与工程2个一级学科硕士点；交通运输工程、土木水利（原建筑与土木工程）和工程管理3个专业学位硕士点；土木工程、工程管理、建筑环境与能源应用工程3个本科专业。土木工程本科专业于2010年率先通过住房和城乡建设部本科教育评估，2017年工程管理专业、2018年建筑环境与能源应用工程专业已相继通过本科专业评估。
学院拥有较雄厚的师资力量和资源。现有教职工113人，教授20人，柔性引进教授1人，国外兼职教授1人，副教授（高级工程师）49人，博士生导师19人，科学硕士生导师54人，专业学位硕士生导师78人，校外兼职硕士生导师34人，专任教师具有博士学位达到80%以上，获得龙江学者、青年学者、黑龙江省教学名师、黑龙江省师德先进个人等诸多荣誉。在校生2038人，其中本科生1712人，研究生326人。学院有三个黑龙江省重点实验室，实验教学中心是黑龙江省实验教学示范中心、黑龙江省“双基”实验室，设有国家林业局工程质量监督总站检测中心，是建设部、交通部、国家林业局定点培训单位。
学院师生员工牢记“学参天地，德合自然”的校训，发扬“育土木人、塑土木魂、聚土木情、兴土木业”的土木精神。经过几代土木人的努力与追求，形成了以道桥为优势，以寒区土木工程技术和管理为特色的特有办学模式，取得了丰硕的育人成果。学院学生在“创新创业、学科竞赛”方面取得了丰硕的成果，创新创业累计经费达110余万元，学科竞赛累计获得国家级奖项80余项，省级奖项112余项。尤其是在“挑战杯”全国大学生课外学术科技竞赛、全国大学生结构设计竞赛、全国大学生节能减排社会实践与科技竞赛中均取得了辉煌的成绩，连续三年获得国家一等奖。
