华东交通大学电气与自动化工程学院的前身是创办于1979年9月的机电系，分设机、电两大类，电力机车专业（1981年招生）和铁道供电专业（1984年招生）属电类专业。

1985年1月，依专业发展的要求，将机电系分为机械工程系和电气工程系。随着电气工程系的不断发展，逐步形成了“电力牵引与传动控制”、“铁道电气化”、“工业自动化”、“计算机应用”、“电子电器”和“建筑电气技术”六个本专科专业。

1996年7月，电气工程系结合学科及专业特色，分别设立电气工程系和电子信息工程系；电气工程系保留了“电力牵引与传动控制”、“铁道电气化”、“建筑电气”（1995年招生）三个本专科专业。

1999年2月，学校将电气工程系和电子信息工程系合并，成立电气信息工程学院，下设“电气工程及其自动化”、“自动化”、“计算机科学与技术”三个本科专业大类。

2002年1月，依学校发展及专业变化的要求，分别成立了电气工程学院和信息工程学院，同年5月，电气工程学院更名为电气与电子工程学院。

2016年5月，依《关于学科、专业调整及学院设置的实施意见》，经校党委会研究，电气与电子工程学院更名为电气与自动化工程学院。

目前，电气与自动化工程学院具有“电气工程及其自动化”、“自动化”、“电子信息工程”、“建筑电气与智能化”及“轨道交通信号与控制”五个本科专业；其中“电气工程及其自动化”、“自动化”两专业为国家级特色专业建设点，“电气工程及其自动化”专业为铁道部特色专业，并入选江西省普通本科高等学校卓越工程师教育培养计划。

经多年努力与发展，电气与自动化工程学院的教学与学科建设取得显著成绩，现有一级学科博士点1个（控制科学与工程），二级学科博士点1个（交通信息工程及控制）；一级、二级学科硕士点共8个；拥有博士后科研流动站1个（控制科学与工程）；江西省一流学科2个（控制科学与工程）（交通运输工程）、江西省重中之重高水平学科1个（控制科学与工程）、江西省重点学科1个（电气工程）、江西省重点实验室1个（江西省先进控制与优化重点实验室）、“江西省轨道交通电气化与自动化工程研究中心”、国家级科研平台“轨道交通基础设施运维安全保障技术国家地方联合工程研究中心”-“牵引供电基础设施方向”等。

在学校党委行政的领导下，学院紧抓“交通特色、轨道核心”的办学定位，重视创新与发展，形成了良好的人才培育环境，近些年在教学、科研及人才培养方面均取得显著成绩，目前学院教师主持在研国家自然科学基金重点、面上、青年及地区项目40余项，省教改研究重点及一般项目50余项，获中国铁道学会科技进步奖及其他省级科研、教学成果奖励10余项，培养出了以“中国青少年科技创新奖”获得者张海强、“中国大学生自强之星标兵”张海龙为代表的大批创新人才典型。

学院现有教职工135人，其中教师104人，实验室人员15人，专职行政人员5人，辅导员13人。教师中教授15人，博士生导师5人，副教授40人，博士38人，在读博士16人，硕士55人，具有硕士以上学位教师的比例为89％。教师中，入选国家级及省级新世纪百千万人才工程人选、江西省教学名师、赣鄱英才555工程人选等10余人，具有在国外访学经历的人员26人。

现有本科生2478人，其中电气工程及其自动化专业1292人，自动化专业382人，电子信息专业205人，建筑电气专业228人，轨道交通信号与控制专业371人。现有研究生274人，其中硕士研究生257人，博士研究生17人。

电气与自动化工程学院专业及学科建设发展：

1979年9月，电力机车专业（1981年招生）、铁道供电专业（1984年招生）、铁道供电及自动控制专业（1982年招生）三个本专科专业；

1985年1月，电力牵引与传动控制专业、铁道电气化专业、工业电气自动化专业（1986年招生）、电子计算机应用专业、电气技术专业（1988年招生）、电子电器专业（1989年招生）六个本专科专业；

1993年12月，经国务院学位委员会第十二次会议批准，我校成为硕士学位授予单位。铁道牵引电气化与自动化被批准为我校首批硕士学位授予点，并于1995年开始招收硕士研究生，同年被确定为江西省重点学科，1997年更名为交通信息工程及控制。

1995年，学校将电气技术专业调整为建筑电气技术专业并继续招生。

1996年，学校将归属电气工程系的专业进行了第一次调整，分别为：工业自动化专业（电力牵引与传动控制方向）、电气技术专业（铁道电气化方向，1998年决定在1996级中增设建筑电气技术方向）。

1999年，电气工程系所属专业进行了第二次调整，将工业自动化专业（电力牵引与传动控制方向）、电气技术专业（铁道电气化方向、建筑电气技术方向）归并为电气工程及其自动化专业，下设电力牵引与传动控制、铁道电气化、建筑电气技术三个专业方向。

1999年4月，学校成立电气信息工程学院，下设电气工程及其自动化、自动化、计算机科学与技术三个本科专业及交通信息工程及控制硕士点，2001年，交通信息工程及控制被确定为江西省“十五”重点学科。

2002年1月，成立电气工程学院，同年5月，电气工程学院更名为电气与电子工程学院，下设电气工程及其自动化（电力牵引与传动控制方向、铁道电气化方向、建筑电气技术方向、城市轨道交通动力与控制方向）、自动化（工业自动化方向、铁道信号方向）等二个本科专业及交通信息工程及控制硕士点。

2002年，电子信息工程专业招生。

2002年9月，电力系统及其自动化硕士点招生、交通信息工程及控制工程硕士招生。

2004年，在电气工程及其自动化专业下增设电力系统及其自动化专业方向。

2005年，新增交通信息工程专业获教育部批准。

2006年交通信息工程专业（铁道信号方向）招生，并同时撤消自动化专业下的铁道信号方向（2010年该专业划归新成立的轨道交通学院）。

2006年3月，电力电子与电力传动、控制理论与控制工程、检测技术与自动化装置等三个硕士点及电气工程硕士学位授权一级学科获得批准。上述三个硕士点于2007年9月招生。

2007年，新增建筑电气与智能化专业获教育部批准设置，2008年招生，并同时撤消电气工程及其自动化专业下的建筑电气技术方向；2011年，新增能源工程及自动化专业获教育部批准设置（目前尚未招生）

2009年3月，新增控制工程工程硕士招生领域.

2009年9月，电机与电器、高电压与绝缘技术、电工理论与新技术等三个硕士点招生

2010年3月，控制科学与工程硕士学位授权一级学科获得批准。

2013年9月，经国务院学位委员会第三十次会议审议批准，华东交通大学被增列为博士学位授予单位，控制科学与工程、交通运输工程等2个学科为博士学位授权一级学科。

2014年10月，经江西省人力资源和社会保障厅“关于公布2014年获准设立博士后科研流动站名单”的通知，华东交通大学（电气与电子工程学院）“控制科学与工程”学科获批准。

2016年5月，依《关于学科、专业调整及学院设置的实施意见》，经校党委会研究，电气与电子工程学院更名为电气与自动化工程学院，“轨道交通信号与控制”专业划归电气与自动化工程学院。

2017年12月，江西省教育厅公示一流学科建设名单，交通运输工程、控制科学与工程学科入选。

2017年12月，国家发改委公示2017年度国家地方联合工程研究中心，“轨道交通基础设施运维安全保障技术国家地方联合工程研究中心”成功入选；其中，“牵引供电基础设施方向”为电气学院交通信息工程及控制学科负责。

经多年的发展与建设，电气与自动化工程学院已逐步形成了以“电气工程及其自动化”、“自动化”、“电子信息工程”、“建筑电气与智能化”、“轨道交通信号与控制”五个本科专业及“控制科学与工程”一级学科博士点和“交通信息工程及控制”二级学科博士点为主线的博、硕、本三个层次并重的人才培养体系。