理学院的前身可追溯到中国人民解放军军事工程学院时期的数学、物理学、理论力学、材料力学等教授会，之后发展成为华东工程学院、华东工学院时期的基础课部，1993年，理学院由独立运行的应用数学系、应用物理系、应用力学系三系合并组建而成。

理学院下设6个系（数学系、统计与金融数学系、应用物理系、信息物理与工程系、力学与工程科学系、土木工程系）、2个教学中心（大学数学基础教学中心、大学物理与实验教学中心）、3个实验中心(物理实验中心、力学实验中心、数学实验中心)，有数学、光学工程、力学3个一级学科博士学位授权点（其中含10个二级学科博士点）、2个二级学科博士学位授权点、7个一级学科硕士点（含26个二级学科硕士点）、3个二级学科硕士学位授权点、4个专业学位工程领域。学院现有7个本科专业：数学与应用数学、信息与计算科学、应用统计学、工程力学、光电信息科学与工程（理）、应用物理学、土木工程，其中5个专业为江苏省品牌（特色）专业。学院现有本科生、硕士和博士研究生1600余人。

学院师资队伍日益优化，现有教职工195人，其中博士生导师26人，教授34人，副教授66人。理学院承担了学校数、理、力等学科方面的重要基础课程。在教学建设和教学改革方面，获得了国家优秀教学团队、国家精品课程、国家教学成果奖以及国家教学名师奖等突出成果。学院的科研实力逐渐增强，每年承担包括国家自然科学基金项目、省部级以上基金项目和国防重点项目等数十项高层次研究项目，2015年度进校科研经费近2700万元。国家自然科学基金等高层次项目获批数量不断增加，目前承担863/973/总装型号等重大课题3项。学院师生发表论文被SCI/E收录数逐年增加，2015年达到百余篇。论文水平也显著提高，多篇文章在本领域国际顶级期刊发表，入选ESI（本领域被引用居全球前1%），陆瑞锋教授团队、阚二军教授团队和蒋立勇副教授分别在世界顶级期刊“Energy&EnvironmentalScience”（影响因子20.523）、NanoLetters（影响因子13.592）和ACSNano（影响因子12.881）上发表研究论文。

多年来，理学院坚持“基础教育教学为立院之本，学科专业发展为强院之路”的办学理念，基础教学与学科专业互动发展，建成了学科、专业颇具规模和特色，教学、科研共同发展的教育实体。理学院全体师生员工将牢牢抓住历史机遇，解放思想、夯实基础、发挥优势、寻求突破，走特色发展之路，向着建设一流学院的目标迈进！