环境科学与工程学院前身为原苏州城市建设环境保护学院环境保护系，2001年更名为苏州科技学院环境科学与工程系，2007年与苏州科技学院城市与环境学系（部分）合并组建环境科学与工程学院。环境工程、环境规划与管理专业于1985年首次招收本科生，其中环境规划与管理专业是国内率先开设的本科专业。1998年给水排水专业并入环境保护系。2007年组建环境科学与工程学院后，并新办建筑环境与能源应用工程本科专业。迄今为止，为国家培养各级各类专业人才7000余人。

学院现有环境工程、环境科学、给排水科学与工程、建筑环境与能源应用工程4个本科专业，在校全日制本科生近2000人。学院拥有环境科学与工程一级学科硕士点、市政工程和供热、供燃气、通风及空调工程两个二级学科硕士点，在校硕士研究生240余人。“土木与环境工程”为江苏高校优势学科一期工程立项建设学科、“环境功能材料与技术”为江苏高校优势学科二期工程立项建设学科、环境工程为江苏省重点学科，环境工程专业为国家级特色专业建设点，环境工程专业被教育部确定为第二批卓越工程师教育培训计划试点专业，环境科学与工程为江苏省重点专业（类），环境工程和环境科学专业为江苏省特色专业。

环境科学与工程学院现有专任教师113人，其中教授27人，副教授43人，博士82人。教师中有全国高校专业指导委员会委员、建设部专业评估委员会委员、江苏省“333”工程第二层次高级专家等在国内学界享有一定声誉的专家学者。

环境科学与工程学院现有城市生活污水资源化利用技术国家地方联合实验室、江苏省环境科学与工程重点实验室，江苏省水处理技术与材料协同创新中心等国家及省部级科研平台。此外学院面向当前环境保护的热点难点问题，与普利兹环境科技有限公司共建海绵城市联合实验室，与思美特表面材料有限公司共建VOC治理联合实验室。

学院设有环境工程系、环境科学系、市政工程系、建筑环境与能源应用工程系4个教学单位和环境科学与工程学院中心实验室。环保楼现有使用面积为8500m2，固定资产8000余万元。学院资料室有专业图书、规范及期刊资料4000余册，长期订阅中外文期刊58种。