为全面对接、融入和服务国家战略及自治区经济社会发展需要，进一步理顺工作机制，加强内涵建设、提升办学水平，打造特色优势明显、质量品牌突出的专业学位研究生教育体系，扩大社会影响力，加快学校事业发展，新疆大学于2020年4月成立商学院。商学院主要面向国家和自治区经济社会发展主战场和人民群众需求，培养党政部门、企事业单位高级管理人才。

 商学院现有工商管理硕士（MBA）、会计硕士（MPAcc）、工程管理硕士（MEM）、旅游管理硕士（MTA）、公共管理硕士（MPA）5个管理类专业硕士学位。新疆大学商学院主要依托新疆大学理论经济学（博士点）、工商管理（硕士点）、机械工程（博士点）、建筑学（硕士点）、土木工程（硕士点）、公共管理（硕士点）、信息与通信工程（硕士点）等学科和相应研究平台，科学高效地整合经济与管理学院、建筑工程学院、智能制造现代产业学院（机械工程学院）、交通运输工程学院、信息科学与工程学院、旅游学院、政治与公共管理学院等相关教学资源和师资力量，开展管理类专业学位硕士研究生培养，形成以教授、副教授和具有博士学位的专任教师为主、兼具较强科研能力和丰富实践经验的校内校外相结合的“双师型”师资队伍。