云南农业大学资源与环境学院成立于2001年4月，前身为农学院土壤农化系和环境科学系。办学历史最早可以追溯到原昆明农林学院于20世纪50年代成立的土壤农业化学教研组，即后来农学院土壤农业化学系的前身。

经过多年的艰辛努力，学院现有：3个本科专业——农业资源与环境、环境科学和设施农业科学与工程；4个硕士点——土壤学、植物营养学、环境科学和水土保持与荒漠化防治；1个农业推广硕士学位点——农业资源利用；1个省级人才培养基地——云南省环境科学与工程创新人才培养基地；1个省级重点学科——植物营养学；1个省级重点建设学科——农业资源利用；1个省级重点专业——农业资源与环境。

学院的组织机构设置体现以教学为中心，综合办公室和党群办公室是服务教学得管理机构，系和实验室是本科教学的执行部门。学院有关教学、科研、人事、分配等重大问题由学院党政联席会议（正副院长和正副党总支书记组成）研究决定。学院实行集体领导，教学行政院长负责制，日常工作由院长全面负责，副院长协助院长按分工负责教学、科研等某一方面的工作。学院党总支书记和副书记负责党务的工作和教工、学生的思想政治工作，对学院工作起保证监督作用。

学院的发展是在各级领导和社会各界的关心支持和全体教职员工的艰辛努力下，取得了今天的成绩。天时、地利、人和，为学院今后的建设和发展提供了坚实的基础和巨大的空间，学院将倍加珍惜今天的机遇，和谐拼搏，牢固树立“育人为本，德育为先”之观念，秉承“开学养正、耕读至诚”之大学精神，激励学子践行“厚德博学、明理尚农”之校训，立足云南、面向西南、辐射全国乃至东南亚，主要为地方经济建设和社会发展服务，以本科教育为主，积极发展研究生教育，培养知识面宽、综合素质高、动手能力强和具有创新精神的应用型高级专门人才。